嵌入式扫描器和固定式扫描器的封装是不一样的，固定式扫描器都具有独立的外壳，里面装有条码扫描引擎，和扫描枪一样，固定式扫描器是直接用USB或者串口进行通讯的。固定式扫描器的密封较好，具有非常不不防水防摔防尘特性。 嵌入式则可以内嵌到自助机器、智能柜、通道门禁或手持设备中，具体哪款嵌入到什么机器受限于扫描模块大小和扫描性能需求等。另外它也能够外置使用放在桌面像扫描枪一样作为移动支付条码扫描引擎，它也可以运用在工业流水线设备中。

使用范围不一样，固定式扫描器的使用范围一般用于周边工作环境、扫描环境比较特殊恶劣的情况下使用，它能够延长使用寿命，而嵌入式扫描器比较适宜应用在对扫码设备要求较高的企业。

价格不同，在性能参数相同的情况下，嵌入式扫描器会比固定式的价格要高。码扫描模组类型众多，应用广泛，而且日后涉及的应用领域会不断增加。